La estación de Morata de Jalón (Zaragoza) se encuentra en el punto kilométrico 272,3 de la línea férrea de ancho ibérico que une Madrid con Barcelona a 404 metros de altitud, entre el apeadero de Purroy y la estación de Ricla-La Almunia.
Cuenta con servicios de Media Distancia Madrid Chamartín-Lérida y Arcos de Jalón/Calatayud-Zaragoza. También tiene funciones logísticas.
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